¶ 正版系统
机身自带的emmc（你可以理解为switch中的硬盘）中的系统，Switch新机出场后就有的东西。
由于目前没有老任扫盘而ban机的报告，我们可以认为正版系统启动后不会因为读取TF卡中的可疑数据而ban机。
因此通过正版系统启动是安全而可靠的。
¶ 大气层破解系统
分为大气层真实破解系统、大气层虚拟系统。
¶ 大气层真实破解系统
较为危险。在了解详情前请不要进入！
在开机的时候，同样也是通过机身自带的emmc来启动系统。但是同时加载大气层破解文件和各种插件等。在设置版本里面可以发现版本号最后一位是 S 。
这个模式主要是用于既想要超频又想要通过正版联机和别人一块玩的人，或者希望享受正版Switch Online服务的人，或者已经被ban机了直接不演了的人。
因此大部分整合包中，都不会对这个模式进行隐藏序列号和屏蔽任天堂DNS，在该模式下机子可以正常连接任天堂服务器。
如果你没有被ban机，在这个模式下，应当只做超频、调整底座模式这些无害且非盗版的功能。并且一定不要安装前端 程序，这会被ns系统记录并上传到任天堂服务器，然后你的机序列号就被ban了。
切记不能安装盗版游戏数据，不能动存档，不能开挂。
¶ 大气层虚拟破解系统
需要在hekate中创建的一类系统。在设置版本里面可以发现版本号最后一位是 E （例如下图是 20.3.0|AMS 1.9.5|E ）。
这种系统的原理是把机身emmc中自带的系统复制一份，放到TF卡中。然后在开机的时候加载TF卡中的系统，并加载大气层破解文件和各种插件等。
文件格式：把emmc完整的复制一份到TF卡，例如你是续航版或者Lite，那么就会在TF卡中emuemmc文件夹里写入32Gb的emmc数据。
分区格式：只是把系统写入TF卡，但是需要把TF卡分区。其中一个分区将会被模拟成机身储存。
根据玩家反馈，似乎分区格式能解决低速卡在某些情况下读取游戏卡顿的情况。但是分区格式不好换卡，需要通过不是那么常见的工具来拷贝分区，而文件格式换卡只需要把两张卡在常见的资源管理器中对拷就行。
在这个系统内，所谓的机身储存方式是在TF卡中模拟的，而TF卡储存方式也在TF卡中，不会有任何数据写入到emmc中。实现了正版系统和虚拟系统的隔离。
一般的整合包都会默认对这个模式进行隐藏序列号、屏蔽任天堂HOSTS。因此你的游戏机在这个系统下是连接不上任天堂的服务器的，因此也不能把记录的各种日志传输到任天堂服务器上面。
（在 设置-主机-序列号信息 ：主机序列号是 XAW00000000000 ，已经被设置为假的了。另外两个序列号是被我用画笔修改照片涂掉的。）
退一步讲，就算连接上了，上传了日志，但是由于序列号是假的的，任天堂也不能通过序列号来ban你的机。
因此你的机在这个系统下是安全可靠的。
¶ 极限超频真实/虚拟破解系统
加载了极限超频组件的系统。
原理与上述系统一致，不过加载了极限超频组件，可以用来超更高的频率。如果贸然调整极限超频组件数据，甚至有可能损伤Switch。
¶ SwitchRoot系统
SwitchRoot是一个组织，他们移植了几个系统到Switch上面。
¶ Android系列
分为8.1，10，11，14，15这几款安卓。但是由于调度不好以及很多使用缺陷，目前刷入安卓的还是较少。
¶ Linux系列
分为Ubuntu，Fedora和Lakka。
参考文献： Switchroot Wiki。